- 人工林定向培育研究组 (首席专家:张建国)
- 林木分子生物学创新团队 (首席专家:卢孟柱)
- 植物地理研究组 (首席专家:江泽平)
- 林木育种研究组 (首席专家:苏晓华)
- 天然林经营研究组 (首席专家:惠刚盈)
- 经济林研究组 (首席专家:王贵禧)
- 林木种质资源研究组 (首席专家:郑勇奇)
- 园林植物研究组 (首席专家:孙振元)
- 林木细胞遗传研究组 (首席专家:齐力旺)
- 林木次生代谢工程研究组 (首席专家:邱德有)
- 针叶树种遗传改良研究组 (首席专家:孙晓梅)
- 珍贵用材树种遗传改良研究组 (首席专家:王军辉)
- 核桃育种与栽培研究组 (首席专家:裴东)
- 林业气象研究组 (首席专家:张劲松)
- 退化生态系统修复研究组 (首席专家:张旭东)
- 城市林业研究组 (首席专家:王成)
- 花卉育种与栽培研究组 (首席专家:王雁)
- 森林微生物研究组 (首席专家:李潞滨)
- 林木遗传育种研究组 (首席专家:张守攻)
- 森林生态系统管理研究组 (首席专家:孟平)