2008年12月17－19日，我所承担的国家科技基础性工作专项重点项目“库姆塔格沙漠综合科学考察”（2006FY110800）在北京召开了第三次学术研讨会暨专家咨询会，会议由科考前方总指挥蔡登谷研究员主持，国家林业局科技司司长张永利出席并讲话。
会议分三段进行：第一阶段，组织各学科组负责人就2008年度库姆塔格沙漠科考的重大科学问题和阶段性成果，展开了充分交流与研讨。第二阶段，由项目主持人卢琦研究员向专家顾问组汇报了2008年度科考取得的阶段性成果及2009年总体工作计划。蒋有绪院士、尹伟伦院士及多位地学界前辈杨根生、董光荣、王苏民、申元村、伍光和、慈龙骏等先后发言，从不同层面、不同角度对项目开展两年来所取得的阶段性成果和2009年工作安排提出了宝贵的建设性意见和建议。第三阶段，12月19日下午，项目组召开学科组长会议，根据专家顾问组的建议进行讨论、总结，进一步完善2009年的工作任务和目标。
2008年，项目组在2007年综合考察的基础上，再次集中多部门、跨行业的科学工作者开展大规模、多学科、系统性综合科学考察，圆满完成了年度工作任务和执行计划。项目组2008年度共进行了8次科学考察（其中主要考察4次），累计参与考察的车辆34辆，行程5万多公里。不仅填补了2007年科考的盲区，并基本实现了“南北合围，东西穿插，拾遗补缺，全面覆盖”的科考预期目标。
