林木次生代谢工程研究组 （首席专家：邱德有）

团队主要围绕红豆杉、狼毒物种的植物分子育种及其次生代谢工程方向展开研究，利用分子手段，获得植物次生代谢产物合成途径中的关键酶基因，通过基因工程方法及调控有关重要调节因子，来获得目的成分得到显著提高的细胞系或转基因植株，为药物规模化生产及培育林木新品系提供技术支撑及物质保障。目前针对MeJA诱导红豆杉细胞系紫杉醇生物合成分子机理进行了探讨研究，鉴定了紫杉醇生物合成途径中的T9αH基因，克隆了多个紫杉醇未知步骤中的候选基因和参与运输、降解相关的基因，并在植物内生真菌中鉴定出了多个紫杉醇生物合成关键酶候选基因，此外，还针对抗艾滋病化合物Prostratin和DPP等二萜类化合物生物合成的分子机理展开了相关的研究。

一种利用RNA干涉技术降低曼地亚红豆杉细胞C–14位氧化紫杉烷含量的方法. 邱德有;李凤岚;胡新玲. 发明专利，00910000834.1，2010.7.21时间倒序

一种利用微小RNA高效抑制曼地亚红豆杉细胞根癌农杆菌转化后褐化现象的方法. 邱德有, 刘敏, 李凤岚.发明专利，200910000837.5，2010.7.21

一种新型生物膜反应器.邱德有.发明专利，ZL200920003643.6，2009.12.19

国家自然基金项目“bHLH调控红豆杉紫杉醇生物合成的分子机理研究”，编号：31300567（2014-2016）；

国家自然基金项目“麻疯树佛波酯合成代谢网络与关键调控基因的功能分析”，编号：31270705 (2013-2016)

国家自然基金项目“红豆杉维管组织干细胞分化韧皮部的分子机理及其定向调控”，编号：31170628（2012-2015）

国家自然基金项目“决定茶树EGCG含量的关键基因筛选与功能分析”，编号：31170651（2012-2015）

中国林业科学研究院院基金项目重点实验室专项“植物内生真菌紫杉醇生物合成分子机理的研究”，编号：CAFYBB2102042（2012-2014）

"国家过技术研究发展计划（863计划）项目“特色植物高效转化技术的研究”，编号：2007AA10Z182 （2007-2010）

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国家自然基金项目“红豆杉细胞微小RNA的表达及其对紫杉醇生物合成相关基因调控作用的分析”，编号：30671698（2007-2009）

国家林业局948项目“虎眼万年青优良种质材料及其繁育技术的引进”，编号：2006-4-81（2006-2010）

国家自然科学基金项目“红豆杉紫杉烷14β-羟基化酶基因表达的抑制及其效应的研究” ，编号：30440033，2005年-2005年

国家自然科学基金项目“茉莉酸类促进红豆杉细胞紫杉醇生物合成机理的研究” ，编号：39970603，2000年-2002年

国家自然科学基金项目“反义ACC合成酶和氧化酶基因对杨树生长发育的影响” ，编号：39500119，1996年-1998年

1. Yang Yanfang, Zhao Hainan, Roberto A Barrero, Zhang Baohong, Sun Guiling, Wilson Iain W, Xie Fuliang, Walker Kevin D, Parks Joshua W, Bruce Robert, Guo Guangwu, Chen Li, Zhang Yong, Huang Xin, Tang Qi, Liu Hongwei, Bellgard Matthew I, Qiu Deyou*, Lai Jinsheng*, Hoffman Angela*. Genome sequencing and analysis of the paclitaxel-producing endophytic fungus Penicillium aurantiogriseum NRRL 62431. BMC Genomics, 2014, 15: 69(*通讯作者).

2. Zhang Nan, Han Zhentai, Sun Guiling, Hoffman Angela, Wilson Iain W, Yang Yanfang, Gao Qian, Wu Jianqiang, Xie Dan, Dai Jungui, Qiu Deyou*. Molecular cloning and characterization of a cytochrome P450 taxoid 9á-hydroxylase in Ginkgo biloba cells. BBRC, 2014, 443: 938-943(*通讯作者).

3. Sun Guiling, Yang Yanfang, Xie Fuliang, Wen Jianfan, Wu Jianqiang, Wilson Iain W, Tang Qi, Liu Hongwei, Qiu Deyou*. Deep sequencing reveals transcriptome re-programming of Taxus × media cells to the elicitation with methyl jasmonate. PLoS One, 2013, 8(4):e62865(*通讯作者).

4. Xie Fuliang, Burklew Caitlin E, Yang Yanfang, Liu Min, Xiao Peng, Zhang Baohong*, Qiu Deyou*. De novo sequencing and a comprehensive analysis of purple sweet potato (Impomoea batatas L.) transcriptome. Planta, 2012, 236(1): 101-113(*通讯作者).

5. Tang Qi, Su Zhiheng, Ma Xiaojun, Xu Derong, Liang Yanhai, Cao Haibo, Wang Xuesong, Qu Xiaoying, Hoffman Angela*, Liu Honhwei, Gu Dizhou, Qiu Deyou*. LC-MS method for detecting prostratin in plant extracts and identification of a high-yielding population of Euphorbia fischeriana. Phytochemistry Letters, 2012, 1: 214: 218(*通讯作者).

6. Tang Qi, Ma Xiaojun*, Mo Changming, Wilson Iain W, Song Cai, Zhao Huan, Yang Yanfang, Fu Wei, Qiu Deyou*. An efficient approach to finding Siraitia grosvenorii triterpene biosynthetic genes by RNA-seq and digital gene expression analysis. BMC Genomics, 2011, 12: 343(*通讯作者).

7. Roberto A Barrero, Chapman B, Yang Yanfang, Moolhuijzen P, Keeble-Gagnère G, Zhang Nan, Tang Qi, Bellgard Matthew I*, Qiu Deyou*. De novo assembly of Euphorbia fischeriana root transcriptome identifies prostratin pathway related genes. BMC Genomics, 2011, 12: 600(*通讯作者).

8. Wang Qiong, Chen Jienan*, Zhang Huaiyun, Lu Mengzhu, Qiu Deyou, Wen Yafeng, Kong Qianqian. Synthesis of Water Soluble Quantum Dots for Monitoring Carrier-DNA Nanoparticles in Plant Cells. Journal of Nanoscience and Nanotechnology, 2011, 11(3): 2208-2214(7). (*通讯作者).

9. Li Fenglan, Ma Xiaojun, Hu Xinling, Hoffman Angela, Dai Jungui, Qiu Deyou*. Antisense-induced suppression of taxoid 14β-hydroxylase gene expression in transgenic Taxus × media cells. Journal of African Biotechnology, 2011, 10: 8720-8728(*通讯作者).

10. Qiu Deyou*, Pan Xiaoping, Wilson Iain W*, Li Fenglan, Liu Min, Teng Wenjing, Zhang Baohong*. High throughput sequencing technology reveals that the taxoid elicitor methyl jasmonate regulates microRNA expression in Chinese yew (Taxus chinensis). Gene, 2009, 436(1-2):37-44(*通讯作者).

11. Qiu Deyou, Wilson Iain W, Gan Siming, Washusen Russell, Moran Gavin F, Southerton Simon G*. Gene expression in Eucalyptus branch wood with marked variation in cellulose microfibril orientation and lacking G-layers. New Phytologist, 2008, 179: 94-103(*通讯作者).

12. Spokevicius Antanas V, Southerton Simon G, MacMillan Colleen P, Qiu Deyou, Gan Siming, Tibbits Josquin FG, Moran Gavin F, Bossinger Gerd*. β-tubulin controls cellulose microfibril orientation in plant secondary fibre cell walls. The Plant Journal, 2007, 51(4): 717-726（* 通讯作者）.

13. Ketchum Raymond EB, Horiguchi Tohru, Qiu Deyou, Williams Robert M, Croteau Rodeny B*. Administering cultured Taxus cells with early precursors reveals bifurcations in the taxoid biosynthetic pathway. Phytochemistry, 2007, 68(3):335-341（* 通讯作者）.

14. Ketchum Raymond EB, Rithner Christopher D, Qiu Deyou, Kim Yousun, Williams Robert M, Croteau Rodeny*. Taxus metabolomics: methyl jasmonate preferentially induces taxoids oxygenated at C-13 in Taxus × media cell cultures. Phytochemistry, 2003, 62:901-909（* 通讯作者）.

15. Wang Lida, Qiu Deyou, Chen Jiyun, Han Yifan, Zheng Junhua, Guo De-an*. Callus cultures of Annona squamosa for the production of annonaceous acetogenins. Journal of Asian Natural Products Research, 2002, 4 (3):171-174（* 通讯作者）.

16. Zhang Junzeng, Zhang Lihe, Wang Xihong, Qiu Deyou, Sun Dian, Gu Jianqiao, Fang Qicheng*. Microbial transformation of 10-deacetyl-7-epitaxol and 1β-hydroxybaccatin I by some fungi from the inner bark of Taxus yunnanensis, Journal of Natural Products, 1998, 61: 497-500.（* 通讯作者）

17. Zhang Junzeng, Tu Fu, Zhang Lihe*, Qiu Deyou. The epimerization of 10-deacetylbaccatin III by Microsphaeropsis onychiuri, a fungus from Taxus yunnanensis. Chinese Chemical Letters, 1997, 8(1): 47-48(*通讯作者).

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