中国红豆杉TcAPLs基因的克隆与表达分析
作 者:李艳艳,杨艳芳,刘洪伟,王帅,邱德有
期刊名称:中草药
影响因子:1.000
卷 期 号:46(10)
页 码:1512-1519
关键词:中国红豆杉; APL 基因; 基因克隆; 生物信息学分析; 表达
论文摘要:
克隆中国红豆杉a lt ered p hl oemd evelopm ent ( APL ) 基因, 研究APL 在中国红豆杉剥皮后树皮再生过程中的表达状况, 以揭示其可能的调控作用机制。方法利用反转录PC R( RT-PCR) 方法克隆得到3 个中国红豆杉APL( TcAPL s ) 基因的c DNA 全长序列, 分别命名为TcAPL l 、TcAPL 2 和TcAPL 3 , 进一步利用生物信息学工具对其进行分析, 最后利用半定量RT-PCR对中国红豆杉不同组织qRT-PC R 技术对其剥皮再生不同时期旳TcAP Ls 进行表达分析。结果系统进化树结果显示, TcAPL l和TcAPL 2 编码的蛋白与川桑的APL 蛋白亲缘关系最近, 聚为一类; TCAPL 3 处在APL 另一个大的独立分支上。组织表达谱分析表明TcAPL l 和TcAPL2 2 个基因主要在根、茎、叶片和韧皮部( 含形成层) 中均高表达; TcAPL 3 在叶片中表达量较高, 而在根和木质部(含形成层) 表达较低。在中国红豆杉剥皮再生过程中, TcAPL l 和TcAPL 2 2 个基因的表达水平随着时间的延长表现为先上升后下降的趋势, 均在3 6 d 下降最明显; TCAPL 3 的表达则在整个组织再生过程中被抑制。结论克隆了 3 个TcAPL s 基因,3 个基因在中国红豆杉剥皮再生过程中均有响应, 推测它们在中国红豆杉植物剥皮后组织再生中起一定的调控作用。