中国红豆杉TcAPL s 基因的克隆及表达分析
作 者:李艳艳, 杨艳芳, 刘洪伟, 王帅, 邱德有
期刊名称:中草药
影响因子:
卷 期 号:46(10)
页 码:1512-19
关键词:中国红豆杉; APL 基因; 基因克隆; 生物信息学分析; 表达
论文摘要:
克隆中国红豆杉a lt ered
p hl oem d evelopm ent ( APL ) 基因, 研究APL 在中国红豆杉剥皮后树皮再生过程中的表达
状况, 以揭示其可能的调控作用机制。方法利用反转录PC R ( RT-PCR) 方法克隆得到3 个中国红豆杉APL ( TcAPL s ) 基因的
c DNA 全长序列, 分别命名为TcAPL l 、TcAPL 2 和TcAPL 3 , 进一步利用生物信息学工具对其进行分析, 最后利用半定量RT-PCR
对中国红豆杉不同组织和qRT-PC R 技术对其剥皮再生不同时期旳TcAP Ls 进行表达分析。结果系统进化树结果显示, TcAPL l
与TcAPL 2 编码的蛋白与川桑的APL 蛋白亲缘关系最近, 聚为一类; TCAPL 3 处在APL 另一个大的独立分支上。组织表达谱分析
表明TcAPL l 和TcAPL2 2 个基因主要在根、茎、叶片和韧皮部( 含形成层) 中均高表达; TcAPL 3 在叶片中表达量较高, 而在根
和木质部(含形成层) 表达较低。在中国红豆杉剥皮再生过程中, TcAPL l 和TcAPL 2 2 个基因的表达水平随着时间的延长表现为
先上升后下降的趋势, 均在3 6 d 下降最明显; TCAPL 3 的表达则在整个组织再生过程中被抑制。结论克隆了 3 个TcAPL s 基因,
3 个基因在中国红豆杉剥皮再生过程中均有响应, 推测它们在中国红豆杉植物剥皮后组织再生中起一定的调控作用。