杨树PtROP家族基因的表达分析与功能预测
作 者:李煜,张进,王丽娟,卢孟柱
期刊名称:林业科学研究
影响因子:
卷 期 号:30(1)
页 码:1-9
关键词:杨树;ROP;基因家族;基因表达模式
论文摘要:
[目的]为探究 ROP基因在林木中的功能。[方法]本研究以杨树为模式,在全基因组水平上对 ROP基因的家族成员、基因结构、保守结构域、氨基酸序列相似性及表达模式进行了分析。[结果]显示,杨树 PtROP基因家族包含13个成员,不同成员间在进化上相对保守,均存在与 GTP结合与水解相关的结构域。这些基因在不同组织、不同胁迫条件下的表达具有明显差异,说明它们参与不同的生物学过程。通过构建功能基因网络(functionalgenenetworkforpoplar)发现 PtROP基因主要参与了信号转导过程。[结论]杨树 PtROP基因家族包含 13个成员参与不同的生物学过程,可能主要参与了信号转导过程。