沙棘H3K9乙酰化修饰全基因组分析
作 者:高国日,张彤,陈道国,何彩云
期刊名称:西北植物学报
影响因子:
卷 期 号:38(2)
页 码:0242-0248
关键词:沙棘;H3K9ac;蛋白质印迹法;染色质免疫共沉淀技术
论文摘要:
:为了绘制沙棘H 3 K 9乙酰化修饰图谱,确定H 3 K 9乙酰化修饰所调控的基因,该实验通过W esternblot验
证抗体与组蛋白的结合能力和ChIP-seq验证抗体富集效率,获得全基因组范围内沙棘H 3 K 9乙酰化修饰图谱和调
控基因。实验结果表明,H3K9ac抗体与复合物具有较强的结合能力。对富集到的D N A 片段进行高通量测序,分
别获得2. 2X 107 和3. 6X 107 条原始序列;唯一比对序列广泛分布于沙棘基因组中,并且在结构基因中的两端具有
明显的富集。对富集区进行峰的预测结果显示,共预测出1 0 1 1 个峰;对峰所处部位基因进行功能预测结果发现,
H3K9ac对于沙棘细胞代谢和信号转导基因的表达具有重要调控作用。沙棘片段化D N A 的富集以及高通量测序
结果证明,抗体能够用于研究沙棘的组蛋白修饰类型,并且绘制了沙棘第一张H 3 K 9乙酰化修饰遗传图谱草图,鉴
定出沙棘H 3 K 9乙酰化修饰所调控的基因,为今后研究组蛋白修饰对沙棘基因表达的调控方式奠定了基础。