毛果杨LBD基因家族的全基因组分析
作 者：芦强，邵芬娟，邱德有
期刊名称：基因组学与应用生物学
影响因子：
卷 期 号：37（1）
页 码：313-315
关键词：毛果杨,LBD 基因家族,系统进化分析,基因表达
论文摘要：
LBD (Lateral Organ Boundaries Domain)蛋白是一类植物所特有的转录因子，在调控植物生长发育、营养代谢以及逆境胁迫的响应等方面发挥重要作用。然而，在基因组水平上对毛果杨LBD基因家族的研究还未曾有过报道。本研究利用生物信息学方法，从毛果杨基因组中鉴定出57个LBD基因并预测其分子量和等电点，这些基因分布于毛果杨18条染色体和Scaffold_65、Scaffold_86上。该家族成员基因结构简单，内含子数目不超过2个。进化关系分析显示毛果杨LBD基因可分为ClassⅠ和ClassⅡ两大类，细分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe、Ⅱa和Ⅱb等7个亚类。分析基因表达模式发现，该家族成员的表达具有一定时空特异性，并响应氮素胁迫处理。本研究为深入研究毛果杨LBD基因的功能奠定了基础。