基于沙棘转录组序列开发EST-SSR分子标记
作 者：李珊珊 ，曾艳飞 ，何彩云 ，张建国
期刊名称：林业科学研究
影响因子：
卷 期 号：30(1)
页 码：69-74
关键词：沙棘；转录组；EST—SSR；引物
论文摘要：
[目的J本研究通过对蒙古沙棘“向阳”品种的转录组序列进行SSR引物开发，为沙棘亲本分析、遗传多样性和
遗传育种等研究提供支持。[方法]利用已测得的转录组序列进行分析和筛选，整理具有SSR位点的序列，进行引
物设计，随机挑选179条引物进行验证。[结果]得到具有SSR位点的EST序列17 383条，其中，单核苷酸、二核苷
酸和三核苷酸重复基元分别占62．77％ 、21．82％和13．77％ ；二核苷酸重复基元类型以AT和AG为主，三核苷酸重
复基元类型以AAG、ATC和ATA为主。9 291条序列设计出扩增EST-SSR位点的引物，随机合成的179对引物中，
142对扩增成功，选取其中92个位点的扩增产物上机检测，4O个SSR位点(43．48％)呈现多态。对扩增稳定且峰图
清晰的17个多态位点的进一步分析，得到蒙古沙棘天然群体在各位点的观测杂合度( )为0．083～ 0．875，期望
杂合度( )为0．180～ 0．750。[结论]本研究开发出的EST—SSR标记，为后期进行沙棘属植物遗传多样性分析、遗
传图谱构建及分子育种等研究提供了重要支持。