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沙棘H3K9乙酰化修饰全基因组分析

作   者:高国日,张彤,陈道国,何彩云
期刊名称:西北植物学报
影响因子:
卷 期 号:38(2)
页     码:0242-0248
关键词:沙棘;H3K9ac;蛋白质印迹法;染色质免疫共沉淀技术
论文摘要:
:为了绘制沙棘H 3 K 9乙酰化修饰图谱,确定H 3 K 9乙酰化修饰所调控的基因,该实验通过W esternblot验
证抗体与组蛋白的结合能力和ChIP-seq验证抗体富集效率,获得全基因组范围内沙棘H 3 K 9乙酰化修饰图谱和调
控基因。实验结果表明,H3K9ac抗体与复合物具有较强的结合能力。对富集到的D N A 片段进行高通量测序,分
别获得2. 2X 107 和3. 6X 107 条原始序列;唯一比对序列广泛分布于沙棘基因组中,并且在结构基因中的两端具有
明显的富集。对富集区进行峰的预测结果显示,共预测出1 0 1 1 个峰;对峰所处部位基因进行功能预测结果发现,
H3K9ac对于沙棘细胞代谢和信号转导基因的表达具有重要调控作用。沙棘片段化D N A 的富集以及高通量测序
结果证明,抗体能够用于研究沙棘的组蛋白修饰类型,并且绘制了沙棘第一张H 3 K 9乙酰化修饰遗传图谱草图,鉴
定出沙棘H 3 K 9乙酰化修饰所调控的基因,为今后研究组蛋白修饰对沙棘基因表达的调控方式奠定了基础。

上一条:李珊珊 ,曾艳飞 ,何彩云 ,张建国. 基于沙棘转录组序列开发EST-SSR分子标记. 林业科学研究. 2017, 30(1): 69-74. 下一条:Guoyun Zhanga, Tong Zhang, Juanjuan Liu, Jianguo Zhang, Caiyun He. Comprehensive analysis of differentially expressed genes reveals the molecular response to elevated CO2 levels in two sea buckthorn cultivars. Gene. 2018, 120-127.

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