不同植物中推定蓖麻烯合酶基因的生物信息学分析
作 者：刘洪伟,杨艳芳,熊王丹, 吴平治,吴国江,邱德有
期刊名称：植物研究
影响因子：
卷 期 号：36(4)
页 码：605～612
关键词：巴豆烷; 蓖麻烯合酶; 生物信息学
论文摘要：
利用 GenBank 中已登录的完整的麻风树、乳浆大戟、蓖麻和乌桕中的 13 个蓖麻烯合酶( Casbene synthase，CS;EC 4． 6． 1． 7) 基因序列，通过生物信息学方法对其核酸及氨基酸序列、组成成分、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质的二级结构、三级结构及功能域等进行了分析预测。结果表明，13 个 CS 基因的 OＲF长度均在 1 647 ～ 1 845 bp，蛋白分子量均在 63． 0 ～ 70． 8 kD，终止密码子为 TGA 或 TAA，理论等电点均小于 7． 0，表明 CS 蛋白呈酸性。氨基酸含量最高的均为亮氨酸。核苷酸同源性比较分析表明，CS 基因主要分为两类。导肽预测发现其中 6 个 CS 具有导肽，均为叶绿体导肽。信号肽和扩模结构域预测发现这些 CS 不存在信号肽和跨膜结构域，肽链整体呈现为亲水性。这些 CS 的主要二级结构元件为 α-螺旋，并且都包含两个萜类合酶功能域。以上研究为进一步探索 CS 基因的功能提供一定理论依据。