2023年全基因组选择技术研讨会会议通知

全基因组选择（Genomic selection, GS）是利用覆盖全基因组标记对育种目标个体进行遗传潜能评估及预测的方法。全基因组选择作为新一代的育种技术，通过构建预测模型，根据全基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

2023年9月9日-13日，应中国林业科学研究院林业研究所邀请，美国华盛顿州立大学张志武教授来我院进行交流访问，进行为期5天的全基因组选择技术专题培训。培训内容包括：基因型与表型数据模拟、全基因组关联分析、分子标记辅助育种、模型拟合与交叉验证、经典统计（gBLUP、rrBLUP）模型、贝叶斯基因组预测模型的概念原理和算法实现。培训班共收学员40名，其中20名分配给中国林业科学研究院，余下20名由张志武教授根据研究基础、编程能力和区域平衡在全国选取，所有学员全部免收培训费。

张志武教授任教于华盛顿州立大学作物与土壤科学系，致力于开发创新的统计方法和计算工具，继而推动人类疾病的攻克和加速动植物重要经济性状的遗传改良。2014年被华盛顿谷物协会授予杰出教授，享受特殊津贴。在全基因组信息应用于动植物选择、育种方面进行了大量创新性研究，提出和发展了用于大规模性状-遗传标记关联分析的紧凑混合线性模型及连锁不平衡分析新技术，是著名基因组数据分析软件TASSEL和GAPIT的开发者和设计者，研究成果发表于Nature Genetics、Science、Briefings in Bioinformatics和Plant Cell等著名学术期刊，文章被引量2万余次（https://zzlab.net）。

参会人员

从事植物、动物、林木、水产和医学等的统计遗传及相关领域的在读研究生、科研人员及企业研发人员。

时间

2023年9月9日-13日；9月8日全天报到。

地点：

北京市海淀区中国林业科学研究院林木遗传育种国家重点实验室B座一楼115-116室

报名

本次研讨会无任何会议费用，不安排接送站，参会人需食宿费用自理，考虑到学习效果，名额有限（40人以内）。

申请人务必将申请材料在8月1日-10日（北京时间）之间用电子信件发送给张苗苗博士（mmzhang@caf.ac.cn）, 邮件题目标明“GS Workshop Beijing 2023”，申请材料（zip压缩格式）包括：大学与研究生成绩单、简历、书面申请（限一页）和导师推荐信。录取人员将在8月20日前得到通知和参会回执表。录取人员须将填写的参会回执表，通过电子邮件以附件形式在8月25日前发送至mmzhang@caf.ac.cn，邮件题目标明“GS Workshop Beijing 2023-回执”。

电脑和软件要求

自备笔记本电脑（Mac，Windows和Linux系统均可），提前安装R及Rstudio软件平台。

联系方式

张苗苗 博士 中国林业科学研究院林业研究所

邮箱：mmzhang@caf.ac.cn；电话：15010431326

卢楠 博士 中国林业科学研究院林业研究所

邮箱：ln_890110@163.com；电话：13522657300

网站

https://zzlab.net/Beijing2023GS

Genomic Prediction Workshop

Chinese Academy of Forestry, Beijing, China

September 9-13, 2023

Instructor:  Dr. Zhiwu Zhang (Zhiwu.Zhang@wsu.edu)

Teaching Assistant: Dr. Jiabo Wang (wangjiaboyifeng@163.com)

Dr. Miaomiao Zhang (mmzhang@caf.ac.cn)

Dr. Nan Lu (n_890110@163.com)

Website: https://zzlab.net/Beijing2023GS

Classroom: Room 115-116, Block B, State Key Laboratory of Forest Genetics and Breeding, Chinese Academy of Forestry, Haidian District, Beijing

Lecture: 8:30 AM-Noon

Lab: 1:30-5:00 PM

Objective:  Develop concepts and analytical skills for modern breeding by using genomic prediction in framework of mixed linear models and Bayesian approaches.

Assessments: Exam (40%) and Project (60%).

Grade and Certificate: A (93%-100%); A- (90%-93%); B+ (87%-90%); B (83%-87%) B- (80%- 83%); C+ (77%-80%); C (73%-77%); C- (70%-73%); D+ (66%-70%); D (60%-66%); and F (0%-60%).

Note: The upper grade will be assigned to a score at a cutting point without rounding. For examples, score of 93.00% receives “A” and score 92.99% receives “A-”. Certificate is available only for grade of D and above.

Exam: September 13, 90 minutes (3:30-5:00 PM), 25 multiple-choice questions.

Project: Due at 5 pm on October 13.

Workshop Schedule

*The equivalent lecture number of CROPS545 (Statistical Genomics) at Washington State University in 2023. PPT and R code are available at https://zzlab.net/teaching.