红豆杉TcLBDs 基因的克隆与表达分析
作 者：李艳艳1 杨艳芳1 王俊青2 王帅1 刘洪伟1 邱德有
期刊名称：林业科学
影响因子：
卷 期 号：Vol. 51，No. 10
页 码：126-133
关键词：红豆杉; LBD; 转录因子; 生物信息学分析; 基因表达
论文摘要：
【目的】LBD( LATEＲAL OＲGAN BOUNDAＲIES DOMAIN)转录因子在植物次生生长中具有潜在的作用。
克隆红豆杉LBD 基因，研究LBD 在红豆杉剥皮后树皮再生过程中的表达状况，以揭示其调控作用。【方法】在红
豆杉剥皮再生组织转录组数据库中搜索LBD 基因，根据获得的基因序列设计引物，利用ＲT-PCＲ 方法克隆得到2
个红豆杉TcLBDs 基因的cDNA 片段，分别命名为TcLBD1 和TcLBD6。进一步利用生物信息学工具对其进行分析，
最后利用半定量ＲT-PCＲ 对红豆杉不同组织、利用qＲT-PCＲ 技术对其剥皮再生不同时期的TcLBDs 的表达进行分
析。【结果】TcLBD1 的cDNA 包含549 bp 开放阅读框(OＲF)，编码182 个氨基酸; TcLBD6 的cDNA 包含687 bp 开
放阅读框，编码228 个氨基酸。TcLBD1 和TcLBD6 编码的蛋白质分子量分别为19. 97，25. 13 kDa，序列分析表明二
者在N 端存在着LBD 类转录因子特有的LOB 结构域，都属于第1 类( Class Ⅰ) LBD; 二者在核酸序列和氨基酸序
列水平上分别有55. 2% 和57. 9% 的相似性，且蛋白质二级结构也具有较高的相似性。系统进化树结果显示
TcLBD1 与北美云杉的蛋白(ABK21479)聚为一簇，亲缘关系最近; TcLBD6 与拟南芥的AS2 /LBD6 聚在一起。组织
表达谱分析表明TcLBD1 在茎和木质部(含形成层)中表达量明显高于根、叶片和韧皮部(含形成层)中的表达量;
TcLBD6 主要在根和茎中表达。2 个TcLBDs 基因在红豆杉剥皮再生不同时期再生组织间的表达模式结果显示，在
其剥皮再生过程中TcLBD1 基因表达量在6 天时达到最高，整体呈上调表达; TcLBD6 表达水平在18 天后显著上
调。【结论】克隆2 个红豆杉TcLBDs 基因，TcLBD1 和TcLBD6，这2 个基因在红豆杉剥皮再生过程中均有响应，推
测二者在红豆杉剥皮后树皮再生过程中起调控作用。