中间锦鸡儿CiDR1的克隆及干旱胁迫下的表达分析
作 者：武苾菲，李万峰，徐海燕，张立峰，齐力旺，韩素英
期刊名称：林业科学研究
影响因子：
卷 期 号：30(2)
页 码：238-244
关键词：中间锦鸡儿；ＣｉＤＲ１；ＴＩＲＮＢＳＬＲＲ；干旱
论文摘要：
［目的］研究并了解中间锦鸡儿 ＣｉＤＲ１基因功能及其对干旱胁迫的响应，为抗性育种提供候选基因。［方法］通过 ＲＡＣＥ技术从中间锦鸡儿中克隆 ＣｉＤＲ１基因的 ｃＤＮＡ全长，利用生物信息学分析软件对其基因结构及功能进行分析和预测。再通过 ｑＲＴＰＣＲ技术对干旱胁迫后的幼苗中的 ＣｉＤＲ１表达模式进行研究。［结果］从中间锦鸡儿中克隆到 ＣｉＤＲ１基因的 ｃＤＮＡ全长共计 ４２９７ｂｐ，ＧｅｎＢａｎｋ登录号为 ＫＰ２７７１００。生物信息学分析表明，预测的 ＣｉＤＲ１蛋白序列中含有 １２４３个氨基酸残基，具有抗病基因特征结构域 ＴＩＲ、ＮＢＡＲＣ、ＬＲＲ等，其等电点为 ６．３５，不稳定指数为 ４２．９１，不具备信号肽，为非分泌蛋白，定位于细胞质中。定量 ＰＣＲ检测发现，ＣｉＤＲ１基因在幼年期的茎中
表达量较低，在成年期的叶片中表达量较高；在干旱胁迫处理后的幼苗中，ＣｉＤＲ１表达水平有明显下降，表明该基因的表达受干旱抑制，可能与中间锦鸡儿适应干旱相关。［结论］中间锦鸡儿在干旱胁迫后其根、茎和叶中 ＣｉＤＲ１的表达均明显下降，表明 ＣｉＤＲ１的表达受干旱抑制，可能与中间锦鸡儿适应干旱相关，进一步研究发现 ＣｉＤＲ１在根、茎、叶中的表达水平可能受发育阶段调控。