小兰屿蝴蝶兰R2R3-MYB 转录因子分析
作 者：王雪霁， 梁立雄， 李潞滨， 王 涛
期刊名称：林业科学研究
影响因子：
卷 期 号：31（3）
页 码：104-113
关键词：小兰屿蝴蝶兰；Ｒ２Ｒ３ＭＹＢ转录因子家族；全基因组分析
论文摘要：
［目的］本研究为了探讨在植物发育和抗逆过程扮演着重要角色的ＭＹＢ转录因子的潜在功能。［方法］利用
拟南芥ＭＹＢ转录因子家族蛋白序列（ＡｔＭＹＢｓ）和已报道的蝴蝶兰Ｒ２Ｒ３ＭＹＢ转录因子家族蛋白序列（ＰｅＭＹＢｓ），
采用本地化软件ＢＬＡＳＴＰ对小兰屿蝴蝶兰全基因组数据库进行搜索，并利用Ｐｆａｍ数据库验证ＭＹＢ结构域，获得小
兰屿蝴蝶兰ＭＹＢ转录因子家族编码序列（ＰｅＭＹＢｓ）１２５条，包含１ＲＭＹＢ结构域的ＰｅＭＹＢｓ蛋白序列２７条，Ｒ２Ｒ３
ＭＹＢ结构域９６条，Ｒ１Ｒ２Ｒ３ＭＹＢ结构域２条。重点对９６条Ｒ２Ｒ３ＭＹＢ结构ＰｅＭＹＢｓ蛋白序列特点进行生物信息
学分析。［结果］依据拟南芥的分类标准将小兰屿蝴蝶兰Ｒ２Ｒ３ＭＹＢ类转录因子划分为２０个亚群，预测获得同源
性较高的直系和旁系同源基因；各基因在四种器官（花、叶、根、茎）中的表达情况各异，３９个ＰｅＭＹＢｓ基因在４种器
官中均表达，４８个基因在不同器官中有特异性不表达现象，一些基因呈现器官特异性表达特点，推测其可能参与相
应组织特定发育时期的调控。［结论］预测获得１２５条ＰｅＭＹＢｓ蛋白序列，并对部分ＰｅＭＹＢ转录因子可能的调控功
能进行了预测，将为细致研究蝴蝶兰ＭＹＢ转录因子调控植物生长发育和逆境胁迫响应的分子机理提供一定的数据
基础。